MII Implementation Guide Microbiology
2027.0.0-ballot2 -
Germany
MII Implementation Guide Microbiology - Local Development build (v2027.0.0-ballot2) built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) Build Tools. See the Directory of published versions
This page lists the ValueSets of the Microbiology module (naming convention
MII_VS_<Module>_<Name>). Each row names what the set is for; follow the link for
its codes and expansion. The code systems they draw from are described on the
Code Systems page; for general guidance on using codes see
FHIR Terminology.
Expansions: ValueSet expansions in this guide are produced by a FHIR
terminology server — SU-TermServ if the client certificate is configured,
otherwise the public HL7 server tx.fhir.org (in which case some KDS-specific
ValueSets may not expand completely).
| ValueSet | Purpose |
|---|---|
| MII VS Labor Laborergebnis Semiquantitativ | Kodierung für semi-quantitative Laborergebnisse |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Bestimmung Ergebnis SNOMED | Ergebnis-ValueSet fuer die allgemeine Bestimmung: der identifizierte Mikroorganismus oder das negative Ergebnis, wenn kein Erreger identifiziert wurde. |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Bestimmung Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die allgemeine Bestimmung: nicht kulturbasierte Verfahren zur Identifikation eines Erregers ohne vordefiniertes Ziel, etwa Mikroskopie oder MALDI-TOF. |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Bestimmung Tests LOINC | Tests-ValueSet für die allgemeine Bestimmung: LOINC-Codes für die ungerichtete Identifizierung eines Mikroorganismus. Bevorzugt wird 41852-5; die übrigen Codes sind gleichwertig zulässig, wo das Labor die Erregergruppe oder das Sequenzierziel im Code benennt. |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Kultur Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die allgemeine Kultur: Kulturverfahren ohne Einschränkung auf einen vordefinierten Erreger, einschließlich aerober und anaerober Bebrütung. |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Kultur Tests LOINC | Tests-ValueSet für die allgemeine Kultur: LOINC-Codes für die ungerichtete kulturelle Untersuchung. Bevorzugt wird 11475-1, weil der Code das Verfahren selbst benennt; 41852-5 ist gleichwertig zulässig. |
| MII VS Mikrobio Allgemeine Mikroskopie Tests LOINC | Tests-ValueSet für die allgemeine Mikroskopie: nominale LOINC-Codes der mikroskopischen Beobachtung, deren Ergebnis die gesehene Morphologie ist. Bevorzugt wird 105059-0, weil es methodenneutral ist; die Codes mit Färbung im Namen (Gram, säurefest, Rhodamin-Auramin) sind gleichwertig zulässig und halten dafür Observation.method frei. |
| MII VS Mikrobio Antigen Antikoerper Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für quantitative Antigen- und Antikörpertests sowie für die Aviditätsbestimmung: immunologische Nachweisverfahren. |
| MII VS Mikrobio Antigen Antikoerper Quantitativ Einheiten UCUM | Einheiten-ValueSet für quantitative Antigen- und Antikörpertests (UCUM). Bindet Observation.valueQuantity.code. |
| MII VS Mikrobio Antigen Antikoerper Quantitative Tests LOINC | Tests-ValueSet für quantitative Antigen- und Antikörpertests: LOINC-Codes für die Messung erregerspezifischer Antigene oder Antikörper. |
| MII VS Mikrobio Aviditaet Ergebnis | Bewertungs-ValueSet für die Avidität: kategoriale Einordnung des Aviditätsindex als niedrig, grenzwertig oder hoch. Niedrige Avidität spricht für eine frische Infektion. |
| MII VS Mikrobio Aviditaet Tests LOINC | Tests-ValueSet für die Aviditätsbestimmung: LOINC-Codes für Aviditätstests einschließlich des Zielantigens. |
| MII VS Mikrobio Bartlett Score LOINC | Ergebnis-ValueSet für den Bartlett-Score: Punktkategorien von +3 bis -1, die das Verhältnis von Entzündungs- zu Epithelzellen und damit die Eignung einer Sputumprobe für die Kultur bewerten. |
| MII VS Mikrobio Befundtyp LOINC | Sepzalisierte Kodierung von mikrobiologischen Befunden |
| MII VS Mikrobio CT Wert LOINC | Tests-ValueSet für den Ct-Wert: LOINC-Codes mit der Eigenschaft Zyklusschwellenwert bei Nukleinsäurenachweisen. |
| MII VS Mikrobio Data Absent Reason | Gruende fuer ein fehlendes Untersuchungsergebnis. Ergaenzt die FHIR-Basiscodes um das unbestimmbare Ergebnis, das zuvor ueber value[x] kodiert wurde. |
| MII VS Mikrobio Detected Not Detected SNOMED | Ergebnis-ValueSet für zielgerichtete qualitative Nachweise: nachgewiesen oder nicht nachgewiesen. Ein unbestimmbares Ergebnis wird nicht hierüber, sondern über Observation.dataAbsentReason abgebildet. |
| MII VS Mikrobio Empfindlichkeit Einheiten UCUM | Einheiten-ValueSet für die phänotypische Empfindlichkeitstestung (UCUM): minimale Hemmkonzentration in mg/L oder Hemmhofdurchmesser in mm. |
| MII VS Mikrobio Empfänglichkeit Genotyp LOINC | Tests-ValueSet für die voraussichtliche Empfindlichkeit: LOINC-Codes für die aus dem Genotyp abgeleitete erwartete Wirksamkeit einer antimikrobiellen Substanz. |
| MII VS Mikrobio Empfindlichkeit Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die phänotypische Empfindlichkeitstestung: die Verfahren, mit denen eine minimale Hemmkonzentration oder ein Hemmhofdurchmesser gemessen wird. |
| MII VS Mikrobio Empfindlichkeit Phenotyp LOINC | Tests-ValueSet für die phänotypische Empfindlichkeitstestung: LOINC-Codes der getesteten antimikrobiellen Substanz. |
| MII VS Mikrobio Färbung SNOMED | Färbeverfahren der mikroskopischen Untersuchung, z. B. Gramfärbung oder Kinyounfärbung. |
| MII VS Mikrobio Keimzahl Einheiten UCUM | Einheiten-ValueSet für die Keimzahlbestimmung (UCUM): koloniebildende Einheiten je Volumen, je Masse oder als Anzahl je Probe. |
| MII VS Mikrobio Keimzahl LOINC | Tests-ValueSet für die Keimzahlbestimmung: LOINC-Codes für die quantitative Bestimmung lebensfähiger Mikroorganismen. |
| MII VS Mikrobio Kultur Ergebnis SNOMED | Ergebnis-ValueSet fuer die allgemeine und die spezifische Kultur: Wachstum, kein Wachstum oder ein nicht eindeutiges Ergebnis. Wie viel gewachsen ist, sagt nicht dieses ValueSet, sondern die Keimzahl. Ein unbestimmbares Ergebnis wird nicht ueber value[x], sondern ueber Observation.dataAbsentReason abgebildet. |
| MII VS Mikrobio Mikroskopie Gesichtsfeld Einheiten UCUM | Einheiten für die Zählung je Gesichtsfeld in der Mengenkomponente der Mikroskopie. |
| MII VS Mikrobio Mikroskopie Semiquantitativ SNOMED | Mengen-ValueSet der Mikroskopie: die semiquantitative Stufe, in der ein mikroskopischer Befund gesehen wurde. |
| MII VS Mikrobio Molekulare Diagnostik Einheiten UCUM | Einheiten-ValueSet für die molekulare Pathogenlast (UCUM): Konzentrationsangaben wie Kopien pro Milliliter. |
| MII VS Mikrobio Molekulare Pathogenlast Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die molekulare Pathogenlast: Amplifikationsverfahren zur Quantifizierung von Erregernukleinsäure. |
| MII VS Mikrobio Molekulare Pathogenlast Tests LOINC | Tests-ValueSet für die molekulare Pathogenlast: quantitative LOINC-Codes für die Nukleinsäurekonzentration eines Erregers. |
| MII VS Mikrobio Morphologie Ergebnis SNOMED | Ergebnis-ValueSet für die Mikroskopie: die mikroskopisch beobachtete morphologische Gruppe, etwa grampositive Kokken in Haufen oder gramnegative Stäbchen. Eine Speziesidentifizierung gehört nicht hierher, auch wenn sie mikroskopisch gestellt wurde. |
| MII VS Mikrobio Morphologie Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die Mikroskopie: die eingesetzten mikroskopischen Verfahren. Die Färbung wird nicht hier, sondern in der Extension MII_EX_Mikrobio_Faerbung angegeben. |
| MII VS Mikrobio MRGN Klasse LOINC | Ergebnis-ValueSet für die MRGN-Klassifikation: 2MRGN, 3MRGN und 4MRGN nach RKI-Kategorisierung. Die negative Einstufung steht im moduleigenen CodeSystem, da die LOINC-AnswerList sie nicht führt. |
| MII VS Mikrobio Organismen SNOMED CT | Organismen-ValueSet: die SNOMED-CT-Hierarchien, aus denen ein identifizierter Erreger stammen kann. Wird nicht direkt gebunden, sondern in die Ergebnis-ValueSets der Bestimmung eingebunden. |
| MII VS Mikrobio Resistenzkategorie Status Ergebnis | Ergebnis der Bewertung eines nachgewiesenen Erregers hinsichtlich der in Observation.code angegebenen Resistenzkategorie. |
| MII VS Mikrobio Resistenzkategorie Status | Untersuchungscodes fuer die Bewertung eines nachgewiesenen Erregers hinsichtlich einer definierten Resistenzkategorie. |
| MII VS Mikrobio Resistenzmechanismen Determinanten LOINC | Tests-ValueSet für Resistenzmechanismen und Determinanten: LOINC-Codes für den Nachweis von Resistenzgenen, Resistenzproteinen und funktionalen Resistenztests. |
| MII VS Mikrobio Resistenzmechanismen Methode SNOMED | Methoden für den Nachweis von Resistenzmechanismen und Determinanten: molekulare, immunologische und funktionale Verfahren. |
| MII VS Mikrobio Spezifische Bestimmung Ergebnis SNOMED | Ergebnis-ValueSet fuer die spezifische Bestimmung: Nachweis oder Ausschluss des Ziels, das bereits im Untersuchungscode benannt ist, einschliesslich der Graubereichsbefunde schwach positiv und nicht eindeutig. Ein unbestimmbares Ergebnis wird nicht ueber value[x], sondern ueber Observation.dataAbsentReason abgebildet. |
| MII VS Mikrobio Spezifische Bestimmung Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die spezifische Bestimmung: nicht kulturbasierte Verfahren des zielgerichteten Erregernachweises, etwa Amplifikation, Immunoassay oder Agglutination. |
| MII VS Mikrobio Spezifische Bestimmung Tests LOINC | Tests-ValueSet fuer die spezifische Bestimmung. |
| MII VS Mikrobio Spezifische Mikroskopie Tests LOINC | Tests-ValueSet für die spezifische Mikroskopie: ordinale LOINC-Codes, bei denen das gesuchte Objekt und die Färbetechnik im Code benannt sind; das Ergebnis ist der Nachweis, die Menge steht in der Mengenkomponente. |
| MII VS Mikrobio Susceptibility Norm | Norm-ValueSet für die Empfindlichkeitstestung: das Normsystem, auf dessen Grenzwerten eine Kategorie beruht. Gebunden an die Extension MII_EX_Mikrobio_Empfindlichkeit_Norm. |
| MII VS Mikrobio Susceptibility | Bewertungs-ValueSet für die phänotypische Empfindlichkeitstestung: die Kategorien sensibel, intermediär, sensibel bei erhöhter Exposition, resistent und nicht sensibel. |
| MII VS Mikrobio Titer Methode SNOMED | Methoden-ValueSet für die Titerbestimmung: Verfahren serieller Verdünnungsreihen. |
| MII VS Mikrobio Titer Tests LOINC | Tests-ValueSet für die Titerbestimmung: LOINC-Codes für semiquantitative Messungen aus Verdünnungsreihen. |
| MII VS Mikrobio Virulenz LOINC | Tests-ValueSet für Virulenzfaktoren: LOINC-Codes für den Nachweis oder Ausschluss von Virulenzdeterminanten. |
| MII VS Mikrobio Voraussichtliche Empfindlichkeit | Ergebnis-ValueSet für die voraussichtliche Empfindlichkeit: die aus genotypischen Nachweisen abgeleitete erwartete Kategorie sensibel, intermediär oder resistent. |